A Pós-graduação do Instituto de Zootecnia é reconhecida pela Portaria MEC 1077, de 31/08/2012, publicada no DOU 13/09/2012 (seção 1, pg 25).

O curso de mestrado, 'Produção Animal Sustentável', possui três linhas de pesquisa direcionadas para profissionais das áreas de zootecnia, medicina veterinária, agronomia, biologia, bioquímica e outras afins, para proporcionar conhecimentos com vistas à produtividade animal, à qualidade do produto e aos impactos ambientais dessas atividades.

O Conselho para Coordenação do Curso de Pós-Graduação (CPG), sob a presidência do Coordenador do Programa, é composto dos seguintes membros:
* Dr. Enilson Geraldo Ribeiro – Diretor Técnico de Departamento
* Dra. Claudia Cristina Paro de Paz - Pró-Reitora
* Dr. Ricardo Lopes Dias da Costa - Coordenador do Programa (CPG)
* Dra. Sarah Figueiredo Martins Bonilha - Vice-Coordenadora do Programa (CPG)
* Dra. Lenira El Faro Zadra - membro titular
* Dra. Flávia Maria de Andrade Gimenes - membro titular
* Dr. Waldssimiler Teixeira de Mattos – membro suplente
* Dra. Maria Eugênia Zerlotti Mercadante – membro suplente

Representando os discentes:
* Rayanne Casabona Castanheira - Membro titular
* Ubiratã Mariano de Souza - Suplente

A eleição para coordenação do curso foi ratificada em reunião de 07/06/2021.